PBMCs gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for clinically significant portal hypertension in HIV/HCV coinfected patients: A cross-control study

Abstract

Los pacientes con cirrosis avanzada presentan un alto riesgo de desarrollar hipertensión portal clínicamente significativa (HPCS). En este estudio se analizó el perfil de expresión génica de las células mononucleares de sangre periférica (CMSP) de pacientes coinfectados por VIH/VHC con el objetivo de identificar una firma de expresión génica asociada a cirrosis avanzada con alto riesgo de HPCS. Se llevó a cabo un estudio transversal en 68 pacientes. La medición de la rigidez hepática (LSM) se utilizó para estratificar a los pacientes en tres grupos: < 12,5 kPa (sin cirrosis, n = 19), 12,5–24,9 kPa (cirrosis, n = 20) y ≥ 25 kPa (cirrosis avanzada con alto riesgo de HPCS, n = 29). Además, se realizó un análisis adicional comparando LSM < 25 kPa (n = 39) frente a ≥ 25 kPa (n = 29). Se extrajo ARN total de las CMSP y se realizó secuenciación de ARN poli(A). Dos transcritos con expresión diferencial significativa (EDS) se validaron mediante PCR cuantitativa en una cohorte independiente (n = 46). Se identificaron 60 transcritos con EDS entre los pacientes con LSM < 12,5 kPa y aquellos con LSM ≥ 25 kPa. El análisis discriminante por mínimos cuadrados parciales mostró que estos 60 transcritos, considerados de forma conjunta, discriminaban adecuadamente a los pacientes con LSM ≥ 25 kPa, con un área bajo la curva ROC (AUROC) de 0,84. Ocho genes presentaron un AUROC ≥ 0,75 para LSM ≥ 25 kPa: cinco se asociaron positivamente con los valores de LSM (SCAMP1, ABHD17B, GPR146, GTF2A1 y TMEM64), mientras que tres se asociaron de forma inversa (ZFHX2-AS1, MDK y STAG3L2). Los dos transcritos con mayor capacidad discriminativa se validaron en una cohorte diferente, observándose diferencias significativas entre los grupos < 25 kPa y ≥ 25 kPa (MDK, p = 0,006; y STAG3L2, p = 0,021). En conclusión, se identificó una firma de expresión génica compuesta por 60 transcritos asociada a cirrosis avanzada con alto riesgo de hipertensión portal clínicamente significativa en pacientes coinfectados por VIH/VHC.