Genome sequence of the biocontrol strain Pseudomonas fluorescens F113

Redondo-Nieto, Miguel; Barret, Matthieu; Morrisey, John; Germaine, Kieran; Martínez-Granero, Francisco; Barahona, Emma; Navazo, Ana; Sánchez-Contreras, María; Moynihan, Jennifer; Giddens, Stephen; Coppoolse, Eric; Muriel, Candela; Stiekema, Willem; Rainey, Paul; Dowling, David; Fergal, O´Gara; Martín, Marta; Rivilla, Rafael
URI: https://hdl.handle.net/10115/27843
DOI: 10.1128/JB.06601-11
Date: 2011-12-19

Résumé

Pseudomonas fluorescens F113 is a plant growth-promoting rhizobacterium (PGPR) that has biocontrol activity against fungal plant pathogens and is a model for rhizosphere colonization. Here, we present its complete genome sequence, which shows that besides a core genome very similar to those of other strains sequenced within this species, F113 possesses a wide array of genes encoding specialized functions for thriving in the rhizosphere and interacting with eukaryotic organisms.

Description

El secuenciamiento de este genoma ha sido financiado por las becas MICROAMBIENTE-CM (para R.R.), BIO2009-08254 (para M.M.), 08/GEN/1319 (para J.P.M.), TSR 3 (Proyecto Agribióticos) (para D.D.) y Marie Curie MIGENOF113 (para M.S.-C. y R.R.). Esta investigación recibió apoyo parcial mediante becas otorgadas a F.O. por la Science Foundation of Ireland (07/IN.1/B948, 08/RFP/GEN1295, 08/RFP/GEN1319 y SFI09/RFP/BMT2350), por el Departamento de Agricultura, Pesca y Alimentación (becas RSF 06-321 y 06-377 y becas FIRM 06RDC459, 06RDC506 y 08RDC629), y por la Comisión Europea (MTKD-CT2006-042062, Marie Curie TOK: TRAMWAYS, EU256596), IRCSET (05/EDIV/FP107/INTERPAM, EMBARK), la beca Marine Institute Beaufort (C&CRA 2007/082), la Agencia de Protección Ambiental (EPA 2006-PhD-S-21 y EPA 2008-PhD-S-2) y el HRB (RP/2006/271, RP/2007/290 y HRA/2009/146).

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