Estudio de la generación del soma en función de métodos de deformación
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2014-11-14
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Resumen
La aplicación utiliza técnicas de deformación, comúnmente usadas en gráficos,
para generar una representación 3D computacional de las neuronas. Sin embargo, se
planteó que podría mejorarse la aplicación mediante la introducción de nuevos métodos
de deformación y el estudio de la calidad de los somas generados. Así, los principales
objetivos de este proyecto son: el planteamiento de técnicas alternativas de deformación
para la generación de somas y la verificación de la calidad de los mismos, mediante la
utilización de métricas y la comparación entre los somas generados con la herramienta a
partir de descripciones incompletas y los modelos 3D segmentados (a partir de datos 3D
completos) aportados por los neurocientíficos.
Descripción
Neuronize es una aplicación informática, que facilita la creación de neuronas
realistas a partir de datos obtenidos de los laboratorios de la descripción morfológica de
una neurona, generando tanto el soma, como las dendritas y permitiendo añadir espinas.
Es frecuente que la descripción morfológica incluya para el soma únicamente
información como el contorno 2D (o un centro y un radio del soma). Estos datos son
insuficientes para reconstruir la forma 3D real. Sin embargo, Neuronize es capaz de
generar una aproximación 3D del soma de una célula a partir de dichos datos
incompletos.
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